Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9Y3F1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9Y3F1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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