Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOP58Q9Y2X3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOP58Q9Y2X3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms