Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SBNO2Q9Y2G9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SBNO2Q9Y2G9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms