Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCDHA12Q9UN75 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHA12Q9UN75 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms