Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEFF2Q9UIK5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEFF2Q9UIK5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEFF2Q9UIK5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEFF2Q9UIK5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEFF2Q9UIK5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEFF2Q9UIK5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEFF2Q9UIK5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms