Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTNNA3Q9UI47 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNNA3Q9UI47 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms