Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHORDC1Q9UHD1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHORDC1Q9UHD1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms