Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VPS29Q9UBQ0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VPS29Q9UBQ0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms