Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PPARGC1AQ9UBK2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPARGC1AQ9UBK2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms