Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMD4AQ9P2Q2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms