Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL42Q9P2K6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms