Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC39.82■■■■□ 3.97
CCDC180Q9P1Z9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
CCDC180Q9P1Z9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC39.76■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC39.76■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC39.76■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC39.76■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
CCDC180Q9P1Z9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms