Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COX16Q9P0S2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COX16Q9P0S2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COX16Q9P0S2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COX16Q9P0S2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
COX16Q9P0S2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COX16Q9P0S2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms