Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP5Q9NZZ3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP5Q9NZZ3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms