Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PGPEP1Q9NXJ5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PGPEP1Q9NXJ5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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