Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COMMD8Q9NX08 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COMMD8Q9NX08 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COMMD8Q9NX08 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COMMD8Q9NX08 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COMMD8Q9NX08 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COMMD8Q9NX08 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COMMD8Q9NX08 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
COMMD8Q9NX08 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COMMD8Q9NX08 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COMMD8Q9NX08 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COMMD8Q9NX08 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms