Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CLN6Q9NWW5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLN6Q9NWW5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms