Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC52A1Q9NWF4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC52A1Q9NWF4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms