Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR3EQ9NVU0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms