Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMBRD1Q9NUN5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms