Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM106BQ9NUM4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms