Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms