Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNTG1Q9NSN8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNTG1Q9NSN8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms