Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOMER3Q9NSC5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOMER3Q9NSC5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms