Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SALL1Q9NSC2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SALL1Q9NSC2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms