Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNGB3Q9NQW8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGB3Q9NQW8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGB3Q9NQW8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGB3Q9NQW8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGB3Q9NQW8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGB3Q9NQW8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGB3Q9NQW8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGB3Q9NQW8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNGB3Q9NQW8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGB3Q9NQW8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGB3Q9NQW8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGB3Q9NQW8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGB3Q9NQW8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGB3Q9NQW8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNGB3Q9NQW8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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