Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IL1RAPQ9NPH3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms