Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VAT1LQ9HCJ6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VAT1LQ9HCJ6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms