Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKRIP1Q9H875 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKRIP1Q9H875 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms