Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXD1Q9GZZ0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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