Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDGFDQ9GZP0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFDQ9GZP0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms