Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSER1Q9C0I3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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