Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM5Q9C035 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM5Q9C035 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms