Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
KRTAP3-1Q9BYR8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP3-1Q9BYR8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms