Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHCHD7Q9BUK0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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