Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
UPK3BQ9BT76 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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