Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLF1Q9BQI6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF1Q9BQI6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms