Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMAD5Q99717 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMAD5Q99717 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms