Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRBNQ96SW2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms