Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPS6KC1Q96S38 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS6KC1Q96S38 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms