Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SCGB3A2Q96PL1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCGB3A2Q96PL1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms