Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLRP3Q96P20 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLRP3Q96P20 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms