Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM20AQ96MK3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM20AQ96MK3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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