Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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SAMD8Q96LT4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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SAMD8Q96LT4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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SAMD8Q96LT4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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SAMD8Q96LT4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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SAMD8Q96LT4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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SAMD8Q96LT4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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SAMD8Q96LT4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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SAMD8Q96LT4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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SAMD8Q96LT4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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SAMD8Q96LT4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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SAMD8Q96LT4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAMD8Q96LT4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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