Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PDLIM2Q96JY6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDLIM2Q96JY6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms