Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK5RAP3Q96JB5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms