Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCC12Q96J65 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms