Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MS4A3Q96HJ5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 PSMG2-210ENST00000590217 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MS4A3Q96HJ5 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms