Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BICD1Q96G01 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BICD1Q96G01 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms