Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RNFT2Q96EX2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RNFT2Q96EX2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms